考虑到中国现代农业发展的不同历史特点，我们将中国现代农业2049研究的2015~2049年这35年划分为三个阶段。
第一阶段，2015~2020年。这一阶段基本与“十三五”规划时间相一致，同时又是中国人口增加趋缓的阶段，也是中长期战略的起步阶段，既要考虑短期亟须解决的问题，又要考虑长期战略的基础性工作。
第二阶段，2021~2030年。这10年中国将面临七个方面的重大转折。
第一，人口的转折点。2014年我国的劳动力人口已经开始下降，而据有关研究，我国总人口可能在2025~2030年达到峰值，到2049年左右，我国总人口将减少至12亿~ 13亿，这意味着我国粮食需求总量将逐步稳定甚至可能下降。
第二，经济的转折点。据国内外有关机构研究预测，我国经济总量将在2020~2030年超过美国位列全球第一，在2049年则可能达到中等发达国家水平。这些转折点将对农业产品的需求结构发生明显变化，主粮消费比例会下降，蛋白质、瓜果等消费比例会上升，而总的热量消费则不会有太大的变化。这意味着未来农业的发展将是产品结构的调整，不再是产量的增加。
第三，二元结构的转折点。随着我国经济的发展和城镇化建设的提速，农业人口比例将不断下降，农业人均生产率将不断提升，农民与第二产业、第三产业的收入差距也将逐步缩小直至不再明显，二元结构得以化解，真正实现农业现代化。
第四，农业科技的转折点。随着科技进步，农业对土地、化肥、农药以及水资源等方面的需求不断下降，生产效率不断提升，资源限制、污染问题和生态问题将逐步得到解决，人类将进入绿色、可持续的生态科技现代农业时代。
第五，农业市场模式的转折点。农业生产方式将实现规模集约化生产，人均产量、人均收入大幅提升，农业的流通也会因互联网与电子商务等科技进步而发生天翻地覆的变化，农业流通渠道将大大缩短，农业生产与农产品消费将与电子超市直接相连，农业生产周期的缩短也将有利于农业需求和供给更好的连接。由于直接、准确、及时地了解了消费需求，供给将更有科学规划性，农业供给保障体系得以科学建立。农产品价格风险对冲体系将直接使农民受益，农产品期货、保险、融资等资本金融体系将在农业得到体系化的应用，现代农业金融体系将全面形成。
第六，土地改革的转折点。土地是农业的核心生产资料，土地制度的创新将像家庭联产承包责任制一样进一步解放农民的生产积极性和创造性，解除生产资料的约束，释放活力。这是建立现代农业和解决农民收入问题的根本基础。
第七，国际合作的转折点。中国人口将在未来35年在达到峰值后将逐渐减少，而全球人口却可能进一步增加，甚至超过90亿。一方面我国需要提升自身农业的国际竞争力，另一方面更需要与其他国家合作进行资源整合，在土地与水资源的全球科学利用方面展开生产、流通、加工等多个环节的合作，共同解决全球粮食与农业需求危机，发挥农业大国作用。
第三阶段，2031~2049年。中国将进入中等发达国家行列，人口将不断减少，并逐步趋于稳定，全球人口、农业和经济政治格局将达到新的均衡，中国与世界将进一步融合，达到“和而不同”的状态。这一时期，中国的经济、政治与文化进入后新常态。
