中国农业面临的五大挑战是什么，第一个挑战是如何长期保障粮食供给问题。“民以食为天。”中国人口多，粮食供给的充足与否关系到社会的稳定，这是历代执政者关注的最高民生问题。经过三十多年的改革开放，中国粮食生产已经实现“十二连增”，粮食供给安全已不再是主要矛盾，伴随中国人口老龄化，中国即将迎来总人口的净减少阶段。同时，伴随着居民收入的不断提高，农业需求将发生质的变化，将由量的增长转移到结构性变化，对主食的需求逐步减少，对蛋白质和水果等副食的需求逐步增加。
第二个挑战是如何实现农民富裕。农民富裕问题是农业现代化的核心。农民收入经常落入产量少、收入少、丰收也不增收的悖论。由于粮食的刚性需求决定了粮食产出收益与总人口成正比，农民增收的唯一有效途径就是减少农民占总人口的比重。这个结论带来了两方面的问题，一是需要第二产业、第三产业更多地吸收从农业转出的劳动力，二是留在农业的劳动力需要提高生产力，即人均农业产出。这样，一方面需要依靠城镇化解决问题，另一方面需要聚集土地等资源发展规模化农样，一方面需要依靠城镇化解决问题，另一方面需要聚集土地等资源发展规模化农业生产能力。由于农业生产周期对农产品供求价格变化反映的滞后性特点，需要建立农业生产者价格风险对冲以及供给稳定的机制。同时，在全球化趋势下，国际农产品价格明显低于国内农产品价格，如何促进农业生产者提高在育种、种养殖、加工、运输仓储和贸易等环节的国际竞争力，也是发展现代农业、实现农民富裕不容忽视的问题。
第三个挑战是新中国成立以后人口增长带来的人均耕地资源和水资源的不足，资源在地域的不均等以及耕地碎片化难以集中生产等方面带来的挑战。中国农业对于耕地肥力的消耗问题也不容忽视，肥力减弱必然带来对化肥等的更多依赖，这关系到农业生产能力能否健康可持续的发展。如果说前面两个挑战可以很好地借鉴发达国家的先进经验，那么第三个挑战必须有面向中国国情的解决方案。
另外两个挑战是中国经济进入新常态凸显出来的新问题，即土地与水的污染以及生产加工运输等环节带来的农产品质量安全问题和农业生产对生态环境的破坏问题。
镉大米、三聚氰胺、农药残留等食品安全事件对中国的相关产业与行业、对居民生活的基本保障和品质提升都构成了极大的威胁，如何保障自然资源和种子与原材料的生产源头、加工运输环节的规范性，以及进一步提高农产品的创新与品质服务，是中国农业现代化面临的新问题。
世界农业的三大源头已经有两河流域和古埃及两大源头因农业造成的生态破坏荒漠化导致文明的灭亡，中国的黄河流域、陕西与中原一带也因数千年的开垦对生态环境甚至气候造成了破坏性影响。如何维持农业与生态的平衡，如何让农业在青山绿水中健康发展，如何保障农业生产世代的可持续性，是延续中华文明这个人类唯一的不断历史、实现民族伟大复兴的更高课题。
